良渚玉琮系软玉雕琢而成，从外观看呈外方内圆、上大下小形。其表面细密的阴纹线刻技艺达到了后世几乎望尘莫及的地步。在既没有青铜、又没有钢铁的良渚时期，对硬度超过一般岩石和各种金属的玉料，是怎样进行加工，使之成为纹饰精美繁细的玉琮呢，至今还困扰着研究良渚古玉的学者。不仅如此，良渚玉琮还以体大自居，更显它独特的魅力。方柱形玉琮四面中间立槽，槽两边基本等距，误差在1毫米左右，每节上下间距也几乎完全相等，而且玉琮兽面纹的构图也基本相同。每个面的转角上有半个兽面，与其相邻侧面转角上的半个兽面组成一个完整的兽面，这样的组合使原本呆板的兽面更显生动且具变化。南京博物院藏良渚玉琮，高7.2厘米，上端宽8.5厘米，下端宽8.3厘米；呈乳白色，柱体筒形，外方内圆，内为圆孔对钻，采用透闪石软玉雕琢而成。四面由1.5厘米宽的直槽分为左右两块，由0.3厘米的横槽分为上下两节；以四角为中线，上下两节各饰造型不同的面纹，且相邻两个侧面的半面纹构成一个完整的面纹；上下面纹由圆眼阔嘴构成，下节面纹由宽鼻、宽嘴、圆眼构成，在眼睑、嘴、鼻的四周饰以由匀称细密的云纹、弧线、横竖短条直线组成的云带。面纹刻画精细得令人惊叹，最细的仅为0.7丝米，内眼圈直径只有2毫米，纹宽一般为0.2－0.9毫米。只有借助放大镜才能清晰可辨，足以反映良渚时期精湛的琢玉水平。
良渚玉琮的用途学术界也众说纷纭，有“男性祖先说”、“地母女阴说”、“图腾柱说”、“礼地说”等，但一般认为玉琮与宗教祭祀、财富权力有关。战国《周礼》书中曾有“苍璧礼天”、“黄琮礼地”之说法。东汉郑玄注“璧圆像天，琮八方像地”。良渚时期的玉琮是否与祭地有关尚在探讨中，看法也不一致。
良渚时期的玉器有很多的谜，尚待后人学者去破译。精美的良渚玉琮则反映了祖国历史的悠久、文化的灿烂，必将会激发人们进一步去研究、探讨，破译良渚时期的谜团。
