大雄宝殿为寺内主要建筑，建于明正统二年，为单檐歇山琉璃顶。殿内现存明代嘉靖四十一年绘制的水陆画９０多平方米，有较高的历史、艺术价值，画工为任朝相。水陆画是专供佛教举办水陆法会时悬挂的宗教人物组画，原为轴幅，后依此绘制为壁画。昭化寺大雄宝殿共绘有水陆画４７幅组 ，三教九流人物４９０多个。根据每幅画右上角的墨书榜题，其内容可分为三类：属于佛教系统的人物画有诸佛、菩萨、诸天、护法神、罗汉等。属于道教系统的人物画有五岳四渎、日月星辰、雷电风雨等。属于儒教系统的人物画有君臣父子、文武官僚、孝子烈女等。另有佛道混合成分的壁画如诸龙神、十殿阎王、六道轮回等。这种把儒、释、道三教人物共同绘于佛教殿堂的现象，在其他地方的明代壁画中也可以见到，如河北省石家庄市西郊毗卢寺毗卢殿水陆画，山西省稷山县青龙寺水陆画等。它反映了宋代以后，儒、释、道三教之间互相影响、互相渗透。而在佛教信仰的基础上，吸取中国道教信仰和儒家观念形成的佛教水陆法会及水陆画，本身就是三教互相融合的产物，它反映了当时的宗教面貌。明代佛教建筑中水陆壁画的盛行，也反映了当时社会各阶层对佛教水陆法会的强烈兴趣，是中国佛教进一步世俗化的表现。昭化寺大雄宝殿水陆画，属工笔重彩人物画，人物形象生动，神态各异，栩栩如生。绘画技法娴熟，线条流畅自如，衣纹绉褶自然，画面旗幡衣带，随风飘拂。这些精美的壁画出自民间画工之手，是我国古代劳动人民创造的优秀文化遗产。壁画规模较大，内容丰富，绘制时间及作者明确，为我们研究明代宗教面貌，绘画艺术、风俗民情等，提供了宝贵约资料。
